Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMBP08949 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMBP08949 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMBP08949 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMBP08949 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMBP08949 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms