Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD55P08174 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD55P08174 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD55P08174 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD55P08174 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms