Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms