Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6BP04259 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms