Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCTN3O75935 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms