Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F6O75461 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F6O75461 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms