Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms