Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms