Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFIT3O14879 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms