Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCKDKO14874 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms