Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms