Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms