Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00587B1AMM8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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LINC00587B1AMM8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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LINC00587B1AMM8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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