Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EME2A4GXA9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms