Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms