Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.7 ms