Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms