Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP3Q9Y2W7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms