Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
L1RE1Q9UN81 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms