Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
USP18Q9UMW8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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