Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO3Q9UK99 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms