Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms