Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS7AQ9UBW8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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