Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms