Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLKQ9UBT6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms