Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms