Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms