Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms