Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3EQ9NVU0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms