Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms