Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHST12Q9NRB3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms