Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4BQ9NPR2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms