Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSU72Q9NP77 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSU72Q9NP77 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms