Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms