Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00597Q9H2U6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms