Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AMBRA1Q9C0C7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMBRA1Q9C0C7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms