Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms