Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BARHL1Q9BZE3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms