Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SALL3Q9BXA9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms