Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC106Q9BWC9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC106Q9BWC9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms