Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTA3Q9BTC8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms