Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms