Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP4Q96PP9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms