Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG8Q96MW5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms