Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms