Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms