Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms