Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB1Q96FW1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB1Q96FW1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms