Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJA3Q96EY1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJA3Q96EY1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJA3Q96EY1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA3Q96EY1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms