Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM12Q96EX1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms